Diferencia entre consenso PCR y pan PCR

Que diferencia principal entre consenso PCR y pan PCR es que La PCR de consenso siempre se dirige a regiones conservadas, mientras que la PCR pan se dirige a regiones variables para identificar diferentes cepas de un grupo.

La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una técnica de amplificación de genes que consta de tres pasos principales, como son la desnaturalización, el recocido y la extensión. Esto se usa comúnmente en diagnóstico e identificación molecular. Las técnicas Consensus PCR y Pan-PCR se basan en los objetivos del cebador que utiliza cada tipo de PCR.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es la PCR de consenso?
3. ¿Qué es Pan PCR?
4. Similitudes entre Consensus PCR y Pan PCR
5. Comparación lado a lado: Consensus-PCR frente a Pan-PCR en formato tabular
6. Resumen

¿Qué es la PCR de consenso?

La PCR de consenso es una técnica de PCR que se dirige a una región conservada para una especie o género específico. Por lo tanto, se eligen regiones altamente conservadas para la amplificación. A través de este método, los organismos pueden identificarse y distinguirse en función de su consenso. Este método identifica una región protegida para una especie en particular. Por ejemplo, la región 16s rRNA de las bacterias sigue siendo una región conservada entre las bacterias. Por lo tanto, solo se requiere un conjunto de cebadores para la amplificación. En la mayoría de los casos, se puede utilizar un cebador universal específico para la región conservada.

Siguiendo un procedimiento de PCR de consenso, se pueden inferir la caracterización de las especies y las relaciones evolutivas. En función de la eficiencia de amplificación del organismo de muestra respectivo, también se pueden sacar conclusiones sobre el consenso del organismo en relación con el grupo. Además, realizar una PCR de consenso es crucial en los estudios filogenéticos. Permite identificar una especie e interpreta la divergencia del organismo particular en relación con el ancestro común.

¿Qué es Pan PCR?

Una pan-PCR es un modo de multiplexación de PCR. En esta técnica, se amplifican diferentes cepas usando diferentes objetivos de cebadores. Sin embargo, las metas pueden ser metas compartidas para los grupos base. Por lo tanto, se pueden usar más de dos conjuntos de cebadores simultáneamente en Pan-PCR. Se puede realizar en un proceso de reacción de un solo tubo o como un proceso de reacción de varios tubos. Pan-PCR requiere más tiempo y es más complejo en comparación con la PCR de consenso. Por este motivo, la interpretación de los resultados de PCR en Pan-PCR también puede ser más compleja.

La principal aplicación de Pan-PCR es en el diagnóstico molecular. Permite la diferenciación entre diferentes cepas de una especie a través de la amplificación de la diana. Pan-PCR es una técnica ideal para identificar diferentes cepas de una sola especie que causan enfermedades. En la mayoría de los casos, la automatización de técnicas pan-PCR para diversas condiciones de salud es muy importante y una técnica confiable y altamente eficiente.

¿Cuáles son las similitudes entre Consensus PCR y Pan PCR?

• Consensus PCR y Pan PCR son dos tipos de técnicas de PCR.
• Ambos métodos siguen el proceso general de tres pasos: desnaturalización, recocido y extensión.
• Usan cebadores que son específicos del objetivo.
• Ambas reacciones tienen lugar en un termociclador.
• Estas reacciones se pueden automatizar.
• Ambos pueden usarse en diagnóstico e identificación molecular; Sin embargo, la precisión varía.
• Estos procedimientos deben ser validados.

¿Cuál es la diferencia entre la PCR de consenso y la PCR pan?

Tanto Consensus como Pan PCR siguen el mismo procedimiento de rutina. Sin embargo, la principal diferencia entre la PCR de consenso y la pan-PCR se basa en los objetivos del cebador que utiliza cada método. Mientras que la PCR de consenso siempre se dirige a regiones conservadas, la PCR pan se dirige a regiones variables para identificar diferentes cepas de un grupo. Debido a esta diferencia, los protocolos de diseño de cebadores, el número de conjuntos de cebadores utilizados y las aplicaciones específicas varían.

Resumen: Consensus PCR frente a Pan-PCR

La PCR introducida por Mulli juega un importante papel revolucionario en las aplicaciones de biología molecular. Consensus y Pan PCR son dos tipos de PCR basados ​​en las regiones de destino de sus cebadores. Mientras que la PCR de consenso se dirige a regiones conservadas, la PCR pan se dirige a regiones variables y desempeña un papel importante en la identificación de cepas. Debido a esta diferencia fundamental entre la PCR consenso y la pan-PCR, las funciones específicas de cada tipo de PCR también varían desde el análisis filogenético hasta la caracterización molecular y el diagnóstico molecular.

Relación:

1. Merkelbach-Brüse, S, et al. "Reacción en cadena de la polimerasa de consenso y ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas para la detección y tipificación del virus del papiloma humano en muestras cervicales". Patología molecular de diagnóstico: Revista estadounidense de patología quirúrgica, parte B, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU., marzo de 1999, disponible aquí.
2. Yang, Joy Y, et al. "Pan-PCR, un método computacional para diseñar ensayos de tipificación bacteriana basados ​​en datos de secuencias del genoma completo". Journal of Clinical Microbiology, Sociedad Estadounidense de Microbiología, marzo de 2013, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Reacción en cadena de la polimerasa" por Enzoklop - Trabajo propio (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia

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